分析测试中心助力我校松阳洲/刘峰团队系统绘制人类细胞核内无膜凝聚体邻近蛋白网络全景图

      细胞核不仅是遗传物质 DNA 的主要存储场所，还包含多种由蛋白质和核酸组成的无膜凝聚体。这些核内亚结构在显微镜下可见，具有高度动态性，并能够与周围核质保持密切的物质交换。典型的核内凝聚体包括核仁（nucleolus）、卡哈尔小体（Cajal body，CB）、Gems小体、PML小体以及组蛋白基因位点小体（histone locus body，HLB）等，它们在基因表达调控与核内空间组织中发挥关键作用。核内无膜凝聚体的功能高度依赖其蛋白质组成，因此，系统性解析其蛋白质互作网络，对于全面阐明凝聚体的分子构成、功能机制及凝聚体间的协同关系，并进一步揭示其在疾病发生发展及应激条件下的时空动态变化，具有重要的生物学意义。

      中山大学生命科学学院松阳洲课题组联合孙逸仙纪念医院基于自主开发的PhastID邻近标记技术，利用分析测试中心高分辨液质联用仪（Orbitrap Fusion Lumos，Thermo），首次系统性捕获了HeLa细胞中18种核内无膜凝聚体的蛋白互作组，绘制出的人类细胞核地图（图1，NOVA Map）揭示了它们在应激条件及疾病相关突变下的动态变化。研究发现，不同凝聚体之间存在广泛的物理接触，并协同完成如端粒酶成熟与组蛋白前体mRNA加工等关键过程。值得一提的是，研究团队还鉴定出一种潜在新的核内凝聚体— BUD13凝聚体（BUD13 NC）。该项工作系统构建了首个人类核内凝聚体地图NOVA Map，为深入理解细胞核内的空间组织及围绕遗传信息流的调控网络提供了全新视角。高分辨率液质联用仪所获得的数据为构建数据库以及展示蛋白质互作组动态提供了关键数据支持，作者在论文中对此表示感谢（图2）。

      相关研究以Proximal proteomics reveals a landscape of human nuclear condensates为题发表在 Nature Cell Biology 上。中山大学生命科学学院李若菲博士（现为中山大学附属第八医院博士后）、李影影博士生，中山大学孙逸仙纪念医院吴苏副研究员为本研究的共同第一作者，生命科学学院松阳洲教授、刘峰副教授、孙逸仙纪念医院吴苏助理研究员为论文共同通讯作者。

      近年来，分析测试中心不断加强仪器功能拓展和技术方法创新，以高水平的分析测试服务扎实支撑学校学科建设与发展。

论文题目：Proximal proteomics reveals a landscape of human nuclear condensates

发表期刊：《Nature Cell Biology》

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41556-025-01809-4

支撑设备：高分辨液质联用仪（Orbitrap Fusion Lumos，Thermo）